W Polsce jest 16 urzędów celno-skarbowych. Pomimo podobnej nazwy, nie należy ich mylić ze zwykłymi urzędami skarbowymi. Kontrole wykonywane przez urzędy celno-skarbowe wykonywane są bowiem nie na podstawie ustawy Ordynacja Podatkowa, lecz Działu V ustawy o Krajowej Administracji Skarbowej. O ile urzędy skarbowe przeznaczone są przede wszystkim do obsługi podatników to urzędy celno-skarbowe są wyspecjalizowane do prowadzenia kontroli, w tym do walki z przestępczością gospodarczą. Dlatego też kontrole prowadzane przez urzędy celno-skarbowe mają nieco inny charakter od tych prowadzonych przez urzędy skarbowe i dotyczą zazwyczaj większych kwot.